Фокин Василий Александрович — различия между версиями

Материал из Wiki СибГМУ
Перейти к: навигация, поиск
 
Строка 7: Строка 7:
  
 
== Биография ==
 
== Биография ==
В 1978 г. окончил Томский университет.
 
  
В 1989 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему "Математическое моделирование кинетики костномозговых эритроидных клеток в норме". В 2009 г. защитил докторскую диссертацию на тему "Модель согласования биомедицинских данных и комплекс программ для интегральной оценки состояния биосистем". Доктор технических наук.  
+
Отец Фокина, Александр Григорьевич (1927–1979), был рабочим.  
  
== Трудовая деятельность ==
+
Мать, Вера Нестеровна (дев. Михеева, 1931–2013), работала швеей.
  
С 1978 по 1990 гг. работал ассистентом кафедры высшей математики Томского медицинского института, с 1991 г. - доцент, заведующий, в настоящее время - профессор кафедры медицинской и биологической кибернетики с курсом медицинской информатики Сибирского медицинского университета (Томск).  
+
После окончания средней школы № 19 Усть-Каменогорска (1973) Фокин поступил на физический факультет ТГУ. Окончил университет (1978) по специальности «физика» с квалификацией «физик», защитив дипломную работу «Расчет основного и первых возбужденных состояний радикалов BH2, NH2, FH2» (научный руководитель доктор физико-математических наук Б.Ф. Самсонов).  
 +
 
 +
В 1978–1990 – ассистент кафедры высшей математики, в 1990–1992 – старший преподаватель, в 1992–2010 – доцент, с 2010 – профессор кафедры медицинской и биологической кибернетики СибГМУ.
 +
 
 +
Ученое звание доцента по кафедре биомедицинской кибернетики присвоено Госкомитетом РФ по высшему образованию в 1994.
 +
 
 +
В СибГМУ читает лекционные курсы «Теоретические основы кибернетики», «Планирование, обработка и представление результатов биомедицинских исследований».
  
 
== Научная деятельность ==
 
== Научная деятельность ==
  
Специалист в области анализа и обработки медико-биологической информации, математического моделирования биосистем, многомерный анализ биомедицинских данных, математическое моделирование в медицине и биологии.
+
Область научных интересов Фокина – математическое моделирование биологических процессов.  
  
Построил математическую модель кинетики системы эритропоэза, учитывающую процессы деления клеток, неэффективного эритропоэза, тип клеточного деления.
+
Фокин построил математическую модель кинетики системы эритропоэза, учитывающую процессы деления клеток, неэффективного эритропоэза, тип клеточного деления: получил соотношения для количества клеток, находящихся в различных стадиях дифференцировки и фазах генерационного цикла, параметров пролиферативной активности эритроидных клеток. С использованием модели провел согласование данных о распределении ядросодержащих эритроидных клеток по стадиям дифференцировки, показав, что выявленные в эксперименте различия в количественных данных могут быть объяснены сдвигом временных границ между стадиями дифференцировки в результате использования различных морфологических критериев идентификации клеток.  
  
Предложил концептуальную модель системы биомедицинских данных, определяемую как совокупность множеств методологических требований, групп и целей пользователей, семантических моделей предметной области и каналов идентификации объекта исследования, элементы которых задаются исходя из формализованного описания предметной области. Модель позволяет сохранять концептуальную взаимосвязь между результатами отдельных исследований и может служить платформой для формирования банков медико-биологических данных с целью оптимизации научно-исследовательских работ по комплексному анализу и оценке состояния сложных биосистем.
+
Фокиным предложена концептуальная модель системы биомедицинских данных, определяемая как совокупность множеств методологических требований, групп и целей пользователей, семантических моделей предметной области и каналов идентификации объекта исследования, элементы которых задаются исходя из формализованного описания предметной области. Модель позволяет сохранять концептуальную взаимосвязь между результатами отдельных исследований и может служить платформой для формирования банков медико-биологических данных с целью оптимизации научно-исследовательских работ по комплексному анализу и оценке состояния сложных биосистем.  
  
Построил прогностическую модель оценки факторов риска онкозаболеваний, в основу которой положено согласование данных анкетирования населения методом мета-анализа данных. С использованием модели проведен анализ результатов анкетного опроса по выявлению факторов риска развития рака молочной железы в группе женского населения, проживающего на территории Сибири и Дальнего Востока, выявлены значимые факторы риска и разработана компьютерная программа для интегральной оценки риска возникновения рака молочной железы.
+
Фокин построил прогностическую модель оценки факторов риска онкозаболеваний, в основу которой положено согласование данных анкетирования населения методом мета-анализа данных. С использованием модели проведен анализ результатов анкетного опроса по выявлению факторов риска развития рака молочной железы в группе женского населения, проживающего на территории Сибири и Дальнего Востока, выявлены значимые факторы риска и разработана компьютерная программа для интегральной оценки риска возникновения рака молочной железы. Создан комплекс проблемно-ориентированных компьютерных программ для интегральной оценки состояния биосистем и проведена его апробация на примерах оценки состояния биосистем разного уровня структурно-функциональной организации: по данным сканирующей электронной микроскопии эритроцитов – системы красной крови при различных локализациях онкологического процесса; по данным оптико-акустического газоанализа спектров поглощения газовыделений – культур колоний бактерий больных бронхолегочными заболеваниями.  
  
Создал комплекс проблемно-ориентированных компьютерных программ для интегральной оценки состояния биосистем и проведена его апробация на примерах оценки состояния биосистем разного уровня структурно-функциональной организации: по данным сканирующей электронной микроскопии эритроцитов - системы красной крови при различных локализациях онкологического процесса.  
+
В 1989 в совете при Институте биофизики СО АН СССР (Красноярск) защитил диссертацию «Математическое моделирование кинетики костномозговых эритроидных клеток в норме» на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук (научные руководители академик РАМН, доктор медицинских наук, профессор Е.Д. Гольдберг, доктор физико-математических наук В.В. Свищенко; утв. ВАК в 1989).
 +
 
 +
В 2009 в совете при ТГУ защитил диссертацию «Модель согласования биомедицинских данных и комплекс программ для интегральной оценки состояния биосистем» на соискание ученой степени доктора технических наук (научные консультанты доктор физико-математических наук Ю.В. Кистенев, академик РАМН, доктор медицинских наук В.В. Новицкий; утв. ВАК в 2010).
 +
 
 +
Фокин принимал участие в работе многих научных форумов. В их числе:
 +
 
 +
* XVI Международный симпозиум «Оптика атмосферы и океана. Физика атмосферы» (Томск, 2009).
 +
* Международная научно-практическая конференция «Развитие научно-технического сотрудничества российского научного и научно-образовательного центров с учеными-соотечественниками, работающими за рубежом» (Томск, 2010).
 +
* Русско-немецкий конгресс по телемедицине «Основы и формы применения телемедицины в России и Германии» (Берлин, 2013).
 +
 
 +
Фокин повышал квалификацию по направлениям «Прикладная статистика» (Новосибирск, 2004); «Педагогика и психология высшей школы» (Москва, 2005); «Методология и современные аспекты изучения биосистем», «Высокопроизводительные вычисления на кластерах» (Томск, 2010).
 +
 
 +
Фокин подготовил 1 кандидата наук.
 +
 
 +
Автор более 120 работ, в том числе 2 монографий, 8 учебно-методических работ (3 учебных пособия с грифами УМО Минздрава и Минвуза РФ). Имеет 5 свидетельств о регистрации программ для ЭВМ, 3 патента.
  
 
== Общественная деятельность ==
 
== Общественная деятельность ==
  
 
Член редколлегии электронного журнала "Вестник науки Сибири".  
 
Член редколлегии электронного журнала "Вестник науки Сибири".  
 +
 +
== Научные труды ==
 +
 +
* Совместно с Ю.В. Кистеневым, О.Ю. Никифоровой, Я.С. Пеккером, А.В. Шаповаловым. Нелинейный анализ медико-биологических данных. Томск, 2007.
 +
* Статистическое моделирование данных при оценке состояния биологических систем // Изв. ТПУ. 2007. № 5.
 +
* Модель уровней согласования биомедицинских данных // Системы управления и информационные технологии. 2008. № 1.
 +
* Совместно с О.А. Ананиной, Л.Ф. Писаревой. Информационная система оценки факторов риска онкологических заболеваний // Изв. ТПУ. 2009. № 5.
 +
* Совместно с А.В. Дубровиным. Представление результатов медико-биологических исследований в виде иерархии классов // Информатика и системы управления. 2009. № 4.
 +
* Совместно с Ю.В. Кистеневым, О.Ю. Никифоровой, Г.Г. Стромовым. Оптимизация интегральных оценок состояния биосистем с использованием параллельных вычислений // Компьютерные исследования и моделирование. 2011. Т. 3.
 +
* Совместно с Г.Г. Стромовым, Г.С. Евтушенко. Интегральная оценка трехмерных биомедицинских изображений с использованием технологии распределенных вычислений // Биотехносфера. 2012. № 3–4.
  
 
== Награды и звания ==
 
== Награды и звания ==
Строка 38: Строка 67:
  
 
== Источники ==
 
== Источники ==
 +
 +
* Профессора медицинского факультета Томского университета – Томского медицинского института – Сибирского государственного медицинского университета (1878-2003): Биографический словарь / С.Ф. Фоминых, С.А. Некрылов, М.В. Грибовский, Г.И. Мендрина, А.И. Венгеровский, В.В. Новицкий. – Томск: Изд-во Том. ун-та, 2004.
  
 
[http://irbis64.medlib.tomsk.ru/cgi-bin/irbis64r_14/cgiirbis_64.exe?Z21ID=&P21DBN=ATHRA&I21DBN=ATHRA&EXP21FMT=fullwebr&C21COM=S&2_S21P02=0&2_S21P03=I=&2_S21STR=AFokin_VasiV2004050763480700 Справочник "Медики России"]
 
[http://irbis64.medlib.tomsk.ru/cgi-bin/irbis64r_14/cgiirbis_64.exe?Z21ID=&P21DBN=ATHRA&I21DBN=ATHRA&EXP21FMT=fullwebr&C21COM=S&2_S21P02=0&2_S21P03=I=&2_S21STR=AFokin_VasiV2004050763480700 Справочник "Медики России"]
 +
 
[[Category:Медицинская кибернетика]][[Category:Сотрудники]][[Category:Профессора]][[Category:Персоны]]
 
[[Category:Медицинская кибернетика]][[Category:Сотрудники]][[Category:Профессора]][[Category:Персоны]]

Текущая версия на 12:57, 18 июля 2019

Фокин Василий Александрович

Доктор технических наук.

Научная сфера: медицинская кибернетика.

Дата рождения: 23.04.1956

Биография

Отец Фокина, Александр Григорьевич (1927–1979), был рабочим.

Мать, Вера Нестеровна (дев. Михеева, 1931–2013), работала швеей.

После окончания средней школы № 19 Усть-Каменогорска (1973) Фокин поступил на физический факультет ТГУ. Окончил университет (1978) по специальности «физика» с квалификацией «физик», защитив дипломную работу «Расчет основного и первых возбужденных состояний радикалов BH2, NH2, FH2» (научный руководитель доктор физико-математических наук Б.Ф. Самсонов).

В 1978–1990 – ассистент кафедры высшей математики, в 1990–1992 – старший преподаватель, в 1992–2010 – доцент, с 2010 – профессор кафедры медицинской и биологической кибернетики СибГМУ.

Ученое звание доцента по кафедре биомедицинской кибернетики присвоено Госкомитетом РФ по высшему образованию в 1994.

В СибГМУ читает лекционные курсы «Теоретические основы кибернетики», «Планирование, обработка и представление результатов биомедицинских исследований».

Научная деятельность

Область научных интересов Фокина – математическое моделирование биологических процессов.

Фокин построил математическую модель кинетики системы эритропоэза, учитывающую процессы деления клеток, неэффективного эритропоэза, тип клеточного деления: получил соотношения для количества клеток, находящихся в различных стадиях дифференцировки и фазах генерационного цикла, параметров пролиферативной активности эритроидных клеток. С использованием модели провел согласование данных о распределении ядросодержащих эритроидных клеток по стадиям дифференцировки, показав, что выявленные в эксперименте различия в количественных данных могут быть объяснены сдвигом временных границ между стадиями дифференцировки в результате использования различных морфологических критериев идентификации клеток.

Фокиным предложена концептуальная модель системы биомедицинских данных, определяемая как совокупность множеств методологических требований, групп и целей пользователей, семантических моделей предметной области и каналов идентификации объекта исследования, элементы которых задаются исходя из формализованного описания предметной области. Модель позволяет сохранять концептуальную взаимосвязь между результатами отдельных исследований и может служить платформой для формирования банков медико-биологических данных с целью оптимизации научно-исследовательских работ по комплексному анализу и оценке состояния сложных биосистем.

Фокин построил прогностическую модель оценки факторов риска онкозаболеваний, в основу которой положено согласование данных анкетирования населения методом мета-анализа данных. С использованием модели проведен анализ результатов анкетного опроса по выявлению факторов риска развития рака молочной железы в группе женского населения, проживающего на территории Сибири и Дальнего Востока, выявлены значимые факторы риска и разработана компьютерная программа для интегральной оценки риска возникновения рака молочной железы. Создан комплекс проблемно-ориентированных компьютерных программ для интегральной оценки состояния биосистем и проведена его апробация на примерах оценки состояния биосистем разного уровня структурно-функциональной организации: по данным сканирующей электронной микроскопии эритроцитов – системы красной крови при различных локализациях онкологического процесса; по данным оптико-акустического газоанализа спектров поглощения газовыделений – культур колоний бактерий больных бронхолегочными заболеваниями.

В 1989 в совете при Институте биофизики СО АН СССР (Красноярск) защитил диссертацию «Математическое моделирование кинетики костномозговых эритроидных клеток в норме» на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук (научные руководители академик РАМН, доктор медицинских наук, профессор Е.Д. Гольдберг, доктор физико-математических наук В.В. Свищенко; утв. ВАК в 1989).

В 2009 в совете при ТГУ защитил диссертацию «Модель согласования биомедицинских данных и комплекс программ для интегральной оценки состояния биосистем» на соискание ученой степени доктора технических наук (научные консультанты доктор физико-математических наук Ю.В. Кистенев, академик РАМН, доктор медицинских наук В.В. Новицкий; утв. ВАК в 2010).

Фокин принимал участие в работе многих научных форумов. В их числе:

  • XVI Международный симпозиум «Оптика атмосферы и океана. Физика атмосферы» (Томск, 2009).
  • Международная научно-практическая конференция «Развитие научно-технического сотрудничества российского научного и научно-образовательного центров с учеными-соотечественниками, работающими за рубежом» (Томск, 2010).
  • Русско-немецкий конгресс по телемедицине «Основы и формы применения телемедицины в России и Германии» (Берлин, 2013).

Фокин повышал квалификацию по направлениям «Прикладная статистика» (Новосибирск, 2004); «Педагогика и психология высшей школы» (Москва, 2005); «Методология и современные аспекты изучения биосистем», «Высокопроизводительные вычисления на кластерах» (Томск, 2010).

Фокин подготовил 1 кандидата наук.

Автор более 120 работ, в том числе 2 монографий, 8 учебно-методических работ (3 учебных пособия с грифами УМО Минздрава и Минвуза РФ). Имеет 5 свидетельств о регистрации программ для ЭВМ, 3 патента.

Общественная деятельность

Член редколлегии электронного журнала "Вестник науки Сибири".

Научные труды

  • Совместно с Ю.В. Кистеневым, О.Ю. Никифоровой, Я.С. Пеккером, А.В. Шаповаловым. Нелинейный анализ медико-биологических данных. Томск, 2007.
  • Статистическое моделирование данных при оценке состояния биологических систем // Изв. ТПУ. 2007. № 5.
  • Модель уровней согласования биомедицинских данных // Системы управления и информационные технологии. 2008. № 1.
  • Совместно с О.А. Ананиной, Л.Ф. Писаревой. Информационная система оценки факторов риска онкологических заболеваний // Изв. ТПУ. 2009. № 5.
  • Совместно с А.В. Дубровиным. Представление результатов медико-биологических исследований в виде иерархии классов // Информатика и системы управления. 2009. № 4.
  • Совместно с Ю.В. Кистеневым, О.Ю. Никифоровой, Г.Г. Стромовым. Оптимизация интегральных оценок состояния биосистем с использованием параллельных вычислений // Компьютерные исследования и моделирование. 2011. Т. 3.
  • Совместно с Г.Г. Стромовым, Г.С. Евтушенко. Интегральная оценка трехмерных биомедицинских изображений с использованием технологии распределенных вычислений // Биотехносфера. 2012. № 3–4.

Награды и звания

  • Профессор.
  • Награжден почетной грамотой администрации Томской области (2010).
  • Лауреат конкурса Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры (2011).

Источники

  • Профессора медицинского факультета Томского университета – Томского медицинского института – Сибирского государственного медицинского университета (1878-2003): Биографический словарь / С.Ф. Фоминых, С.А. Некрылов, М.В. Грибовский, Г.И. Мендрина, А.И. Венгеровский, В.В. Новицкий. – Томск: Изд-во Том. ун-та, 2004.

Справочник "Медики России"