Фокин Василий Александрович

Фокин Василий Александрович

Доктор технических наук.

Научная сфера: медицинская кибернетика.

Дата рождения: 23.04.1956

Биография

Отец Фокина, Александр Григорьевич (1927–1979), был рабочим.

Мать, Вера Нестеровна (дев. Михеева, 1931–2013), работала швеей.

После окончания средней школы № 19 Усть-Каменогорска (1973) Фокин поступил на физический факультет ТГУ. Окончил университет (1978) по специальности «физика» с квалификацией «физик», защитив дипломную работу «Расчет основного и первых возбужденных состояний радикалов BH2, NH2, FH2» (научный руководитель доктор физико-математических наук Б.Ф. Самсонов).

В 1978–1990 – ассистент кафедры высшей математики, в 1990–1992 – старший преподаватель, в 1992–2010 – доцент, с 2010 – профессор кафедры медицинской и биологической кибернетики СибГМУ.

Ученое звание доцента по кафедре биомедицинской кибернетики присвоено Госкомитетом РФ по высшему образованию в 1994.

В СибГМУ читает лекционные курсы «Теоретические основы кибернетики», «Планирование, обработка и представление результатов биомедицинских исследований».

Научная деятельность

Область научных интересов Фокина – математическое моделирование биологических процессов.

Фокин построил математическую модель кинетики системы эритропоэза, учитывающую процессы деления клеток, неэффективного эритропоэза, тип клеточного деления: получил соотношения для количества клеток, находящихся в различных стадиях дифференцировки и фазах генерационного цикла, параметров пролиферативной активности эритроидных клеток. С использованием модели провел согласование данных о распределении ядросодержащих эритроидных клеток по стадиям дифференцировки, показав, что выявленные в эксперименте различия в количественных данных могут быть объяснены сдвигом временных границ между стадиями дифференцировки в результате использования различных морфологических критериев идентификации клеток.

Фокиным предложена концептуальная модель системы биомедицинских данных, определяемая как совокупность множеств методологических требований, групп и целей пользователей, семантических моделей предметной области и каналов идентификации объекта исследования, элементы которых задаются исходя из формализованного описания предметной области. Модель позволяет сохранять концептуальную взаимосвязь между результатами отдельных исследований и может служить платформой для формирования банков медико-биологических данных с целью оптимизации научно-исследовательских работ по комплексному анализу и оценке состояния сложных биосистем.

Фокин построил прогностическую модель оценки факторов риска онкозаболеваний, в основу которой положено согласование данных анкетирования населения методом мета-анализа данных. С использованием модели проведен анализ результатов анкетного опроса по выявлению факторов риска развития рака молочной железы в группе женского населения, проживающего на территории Сибири и Дальнего Востока, выявлены значимые факторы риска и разработана компьютерная программа для интегральной оценки риска возникновения рака молочной железы. Создан комплекс проблемно-ориентированных компьютерных программ для интегральной оценки состояния биосистем и проведена его апробация на примерах оценки состояния биосистем разного уровня структурно-функциональной организации: по данным сканирующей электронной микроскопии эритроцитов – системы красной крови при различных локализациях онкологического процесса; по данным оптико-акустического газоанализа спектров поглощения газовыделений – культур колоний бактерий больных бронхолегочными заболеваниями.

В 1989 в совете при Институте биофизики СО АН СССР (Красноярск) защитил диссертацию «Математическое моделирование кинетики костномозговых эритроидных клеток в норме» на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук (научные руководители академик РАМН, доктор медицинских наук, профессор Е.Д. Гольдберг, доктор физико-математических наук В.В. Свищенко; утв. ВАК в 1989).

В 2009 в совете при ТГУ защитил диссертацию «Модель согласования биомедицинских данных и комплекс программ для интегральной оценки состояния биосистем» на соискание ученой степени доктора технических наук (научные консультанты доктор физико-математических наук Ю.В. Кистенев, академик РАМН, доктор медицинских наук В.В. Новицкий; утв. ВАК в 2010).

Фокин принимал участие в работе многих научных форумов. В их числе:

• XVI Международный симпозиум «Оптика атмосферы и океана. Физика атмосферы» (Томск, 2009).
• Международная научно-практическая конференция «Развитие научно-технического сотрудничества российского научного и научно-образовательного центров с учеными-соотечественниками, работающими за рубежом» (Томск, 2010).
• Русско-немецкий конгресс по телемедицине «Основы и формы применения телемедицины в России и Германии» (Берлин, 2013).

Фокин повышал квалификацию по направлениям «Прикладная статистика» (Новосибирск, 2004); «Педагогика и психология высшей школы» (Москва, 2005); «Методология и современные аспекты изучения биосистем», «Высокопроизводительные вычисления на кластерах» (Томск, 2010).

Фокин подготовил 1 кандидата наук.

Автор более 120 работ, в том числе 2 монографий, 8 учебно-методических работ (3 учебных пособия с грифами УМО Минздрава и Минвуза РФ). Имеет 5 свидетельств о регистрации программ для ЭВМ, 3 патента.

Общественная деятельность

Член редколлегии электронного журнала "Вестник науки Сибири".

Научные труды

• Совместно с Ю.В. Кистеневым, О.Ю. Никифоровой, Я.С. Пеккером, А.В. Шаповаловым. Нелинейный анализ медико-биологических данных. Томск, 2007.
• Статистическое моделирование данных при оценке состояния биологических систем // Изв. ТПУ. 2007. № 5.
• Модель уровней согласования биомедицинских данных // Системы управления и информационные технологии. 2008. № 1.
• Совместно с О.А. Ананиной, Л.Ф. Писаревой. Информационная система оценки факторов риска онкологических заболеваний // Изв. ТПУ. 2009. № 5.
• Совместно с А.В. Дубровиным. Представление результатов медико-биологических исследований в виде иерархии классов // Информатика и системы управления. 2009. № 4.
• Совместно с Ю.В. Кистеневым, О.Ю. Никифоровой, Г.Г. Стромовым. Оптимизация интегральных оценок состояния биосистем с использованием параллельных вычислений // Компьютерные исследования и моделирование. 2011. Т. 3.
• Совместно с Г.Г. Стромовым, Г.С. Евтушенко. Интегральная оценка трехмерных биомедицинских изображений с использованием технологии распределенных вычислений // Биотехносфера. 2012. № 3–4.

Награды и звания

• Профессор.
• Награжден почетной грамотой администрации Томской области (2010).
• Лауреат конкурса Томской области в сфере образования, науки, здравоохранения и культуры (2011).

Источники

• Профессора медицинского факультета Томского университета – Томского медицинского института – Сибирского государственного медицинского университета (1878-2003): Биографический словарь / С.Ф. Фоминых, С.А. Некрылов, М.В. Грибовский, Г.И. Мендрина, А.И. Венгеровский, В.В. Новицкий. – Томск: Изд-во Том. ун-та, 2004.

Справочник "Медики России"